Das IVI richtet sich an folgende Zielgruppen:
- Vollzugsbehörden der Kantone
- Bundesamt für Lebensmittelsicherheit und Veterinärwesen (BLV)
- Bundesamt für Gesundheit (BAG)
- Schweiz. Nationalfonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung (SNF)
- Staatssekretariat für Bildung und Forschung (SBF)
- Praktizierende Tierärztinnen und Tierärzte
- Veterinärmedizinische Labors in der Schweiz
- Impfstoffproduzenten und -vertreiber
- Nationale und internationale Referenzlaboratorien
- Nationale und internationale Kollaborationspartner im Bereich Hochschule und Industrie